Concernant la formation initiale d’ingénieurs, l’unité est impliquée dans les formations de 3ème cycle et tout particulièrement la spécialisation de troisième année « Performances et Innovation dans les systèmes techniques de production végétale ».
Les interventions portent sur les savoir-faire utile à l’ingénieur agronome pour concevoir et évaluer les systèmes de culture. La participation à l’enseignement porte également sur les apports de connaissances relatives au fonctionnement des agroécosystèmes, avec en particulier une part croissante de la formation consacrée à l’étude de la composante biologique.
L’UMR est également régulièrement sollicitée pour intervenir dans différentes formations pour plusieurs établissements : Université Paris XII (DESS "Gestion des systèmes agro-sylvo-pastoraux en régions tropicales", dans lequel un ingénieur de l’unité est fortement investi avec une responsabilité de module), ISARA à Lyon, ESA à Angers, ISA de Lille.
La contribution à la formation par la recherche concerne en premier lieu la mention Espaces, Ressources, Milieux du master Sciences et Technologies du Vivant et de l'Environnement d’AgroParisTech, et en particulier sa spécialité de M2 "De l'agronomie à l'Agro-écologie". Cette spécialité a été créée en 2010, faisant suite à la spécialité "Agronomie". L’UMR s’est fortement investie dans ce projet qui vise à tenir compte, dans la formation des futurs cadres de la recherche ou de la recherche-développement, des différentes évolutions actuelles de l'agronomie.
L’UMR est équipe d’accueil de l’école doctorale ABIES (commune à AgroParisTech, l’ENVA, l’ENSP et à laquelle émargent également les Universités Paris VII, XI, et XII). Dans le cadre des activités de cette ED, l’UMR, avec le département SIAFEE, participe à l’animation du volet « systèmes de culture », faisant de l’Ecole Doctorale ABIES un lieu où se regroupent des thèses sur les systèmes de culture (réalisées dans des laboratoires et contextes socio-économiques variés, et sur des thèmes couvrant l’ensemble des questions liées à la problématique).
Les membres de l’unité contribuent de manière très significative à l’accompagnement des thèses de doctorat et, dans une moindre mesure, des HDR à travers les participations à des jurys de thèse et d’HDR et à de nombreux comités de pilotage pour des travaux menés dans d’autres équipes, ce qui témoigne d’une reconnaissance significative de nos travaux à l’extérieur de l’unité.
Enfin, L’UMR participe également à la formation continue pour (i) des ingénieurs essentiellement du développement agricole, en situation professionnelle, (ii) de jeunes chercheurs ou de chercheurs en reconversion. Elle contribue en effet à la formation d’ingénieur en alternance à destination de techniciens supérieurs délivrée par l’Institut des Techniques de l’Ingénieur pour l’Agriculture, structure commune à AgroParisTech, au CNAM et à l’APCA, et à divers cycles à la demande de professionnels ou d’autres organismes de recherche (CIRAD). En outre, plusieurs membres de l’unité ont participé à ou co-organisé les écoles chercheurs INRA (par exemple l'Ecole chercheur sur les régulations biologiques dans les agrosystèmes en 2007).
